İngilizce: Permanent Secretariat Of The Convention
BMÇMS'nin 23. maddesi uyarınca tesis edilmiş olan sözleşme daimi sekretaryası 1999 Ocak ayından beri Almanya’nın Bon şehrindeki ofisinde hizmet vermektedir. Sekretaryanın görevi, taraflar konferansının toplantılarını düzenlemek ve alt kuruluşlarının faaliyetlerine yönelik hizmetleri sağlamaktır. Taraflar Konferansınca hazırlanan 10 yıllık Strateji, sekretaryanın 2008-2018 döneminde yükleneceği görevleri tanımlamaktadır.