ASO, PZR ve jel elektroforezi kullanarak aranan mutasyonun varlığını tespit etmeye yarar. 20-25 baz uzunluğunda hedef DNA’ya özgü problar, DNA ile muamele edilir ve probun ışıma yaptığı maddeye göre radyoaktivite veya floresan ile analiz edilir. Mutasyonlu DNA’ya tam bağlanamayan probun ışıması düşük olur.