Allel sıklığı, bir popülasyonda bir gen varyantının o allel için bulunan bütün genlere olan oranıdır. Genelde yüzdelerle ifade edilir. Popülasyon genetiğinde allel sıklığının bireysel, türe bağlı veya popülasyona bağlı genetik çeşitliliği göstermektedir.