Genomdan yazılım ile oluşan mRNA ifadelerinin eş zamanlı incelenmesidir. Bir örnekte bulunan RNA miktarına bağlı olarak, genlerin seçilmiş bir alt grubunun veya tamamının anlatım düzeyini ölçmeyi hedeflemektedir. Transkriptom, bir hücredeki tüm RNA moleküllerini ifade eder; mRNA, rRNA, tRNA ve kodlamayan RNA lar.